De meeste CopyBox duplicators kunnen optioneel worden uitgerust met een interne harddisk. Een aantal modellen worden standaard geleverd met een interne harddisk (de PC-connected en 19" modellen).

Op de interne harddisk kunnen "images" van CD's, DVD's en BDR's worden opgeslagen. Images die vaker gebruikt worden kunnen op de interne harddisk van de duplicator bewaard worden zodat de master disk niet meer nodig is. Bij dupliceren vanaf de interne harddisk is een maximaal stabiele datadoorvoer gegarandeerd; leesfouten zijn uitgesloten. Bij "On-the-Fly" dupliceren (rechtstreeks vanaf de lezer naar de branders) kunnen wel leesfouten optreden, bijvoorbeeld wanneer de master disk beschadigd, vuil of slecht beschreven is. De interne harddisk is opgedeeld in partities van 1GB welke alfabetisch geordend zijn. Indien een disk image groter is dan 1GB worden meerdere partities gecombineerd.

De belangrijkste voordelen van de harddisk:

Maximale kopieersnelheid; de CD/DVD/BDR lezer van een CopyBox duplicator heeft een maximale DVD leessnelheid van 18x speed. Indien data vanaf de interne harddisk wordt gelezen kunnen DVD kopieersnelheden tot 24x speed bereikt worden.
Maximaal stabiele datadoorvoer; een harddisk heeft een stabielere datadoorvoer dan een CD/DVD/BDR lezer. Tijdens dupliceren vanaf de harddisk kan er nooit een leesfout optreden, dit is wel mogelijk bij "On-the-Fly" dupliceren.
De interne harddisk maakt het mogelijk om veelgebruikte CD/DVD/BDR images op de CopyBox op te slaan en deze direct beschikbaar te hebben.